Sous l'impulsion d'Antoine Gallimard, il fut ensuite à l'origine de L'Arpenteur, une "cellule éditoriale autonome dédiée à ses choix et paris d'éditeurs", selon le site des éditions Gallimard. Refusant de prendre en charge une maison d'édition entière, Gérard Bourgadier avait accepté cependant de créer un département pour publier des textes qui lui plaisaient.
"L'Arpenteur officierait donc à son seul gré, chaque couverture de la nouvelle collection portant de façon significative une vignette assortie d'une anagramme aisément déchiffrable “G.E.R.A.R.D. B.”", explique le site des éditions Gallimard.
La première gorgée de bière
En 1997, il tire à 2 000 exemplaires un texte de Philippe Delerm, intitulé La première gorgée de bière. Le livre va rester deux ans dans les meilleurs ventes et, en 2014, Gallimard commandera la 152e réimpression de l'ouvrage. Au total, 1,2 million d'exemplaires ont été écoulés.
Dans Bilan. Carnet X, publié chez Gallimard en 2003, Louis Calaferte écrivait : "Lundi 25 juillet 1988. Appel téléphonique de Gérard Bourgadier. Son enthousiasme heureux en m'annonçant que la couverture de Memento Mori, dont la maquette a été composée ces jours derniers sous sa direction, est, selon ses termes, "superbe par son élégance discrète". La passion qui s'exprime ainsi fait de cet homme ce qui a pratiquement disparu aujourd'hui : un éditeur".